豆漿中還有一些通常所說的「生物活性成分」，比如卵磷脂和異黃酮。科學家們進行了許多研究來檢測這些成分對於人體健康的影響。不過，迄今為止還沒有形成一致的意見。異黃酮作為一種植物雌激素，有一些研究表明它能減輕女性更年期症狀，甚至減輕某些癌症的發生風險，另一些研究認為它不具有這樣的功能，還有研究甚至顯示它對健康有不利影響。美國心臟協會的總結意見是沒有傳說中的「保健功能」。而卵磷脂，主要是用作乳化劑，一些零星的「降低膽固醇」的作用也沒有得到廣泛認可。
不過，不管這些「活性成分」的功能（有益的或者有害的）存不存在，在豆漿等豆製品中的作用都很微弱。對於人們來說，「無害」比「有益」更為重要。在這個前提下，豆漿的「優質蛋白」和「降低膽固醇」使得它成為了優質食品。在美國，學術界、工業界、主管部門和多數消費者，傾向於認為用豆漿代替牛奶是一種更健康的選擇。
不過，絕大多數西方人很不喜歡豆味，尤其是豆製品在保存中有一些成分容易被氧化而產生很糟糕的味道。所以美國的豆漿有一步去除或者掩蓋豆味的操作，而中國人都不喜歡，覺得「一點豆漿味也沒有」。對奶味的偏好和豆味的排斥，是豆漿在西方不夠受歡迎的原因。
近年來，隨著對健康的關注和豆漿加工技術的改進，豆漿在美國的市場也越來越大。另外，豆漿在保存過程中比牛奶容易發生聚集下沉，這也給豆漿成為牛奶那樣的方便食品帶來了難度。保存難度高，加上市場需求量不是那麼大，導致了美國豆漿的價格大大高於牛奶。
對國人來說，豆味和保存的問題都不存在。國人喜歡豆味的可能比喜歡奶味的還多一些。人們願意在家裡自己打豆漿，或者在早點攤上買，都是新鮮的，不需要保存。
相比於牛奶，豆漿最大的劣勢是含鈣量低，但商業化的豆漿則是直接往裡補充鈣。另外豆製品也是一種過敏原，能導致一部分人過敏。
總的來說，牛奶和豆漿都是很好的食品，在補充蛋白質上同樣高效。牛奶的長處在於補鈣，短處是不利於心血管不利於減肥；而豆漿則正好相反，長處是有利心血管有利減肥，短處就是天然沒有鈣。
