之後林清江擔任部長的時候，爆發「建構式數學」災難。這個時期揚棄傳統九九乘法表、把建構式數學教法加入教科書，讓當時許多數學老師不會教、學生也不會學，社會爭議很大，史稱「建構式數學之亂」。這樣的一場災難，直到民進黨上台後、黃榮村擔任教育部長才喊卡，終於，又回到九九乘法表年代，災難終告平息。

但隨之而來的，黃榮村擔任教育部長時，推動高等教育評價，建立對各大學評量的評鑑、來決定要補助大學的預算，推動邁向一流大學計畫、五年五百億來引導大學，同時將SCI、SSCI的論文數量納入大學評鑑中，此舉為台灣學界帶來另一場的災難，就是讓所有的大學教授都變成論文產生器，各大學教授不斷地衝刺數量，作為升等的依據，然而垃圾論文不斷，就變成這項政策的嚴重後遺症，最終台灣鬧出了論文審查造假這種國際笑話。

而最曲折有趣的莫過於「十二年國教」的推動。阿扁執政、電火球當行政院長的時候，曾經出來喊說要推動十二年國教，蘇貞昌一講，不得了，建中、北一女、附中等一流學區附近的房價開始飆漲。

結果，電火球還沒爽完、爐火都還沒燒熱，教育部長杜正勝回了他一巴掌：杜老爺說，這項政策根本就不成熟，還有很多東西要研究、沒想清楚，貿然推出只是災難，所以，「卡」！

沒想到這個政策在國民黨重返執政後，教育部長鄭瑞城跟媒體說：還不成熟、不宜貿然推動。顯然他很知道問題多多、不好搞。結果馬英九身邊其他的學者痛批鄭瑞城，搞得鄭瑞城不得不下台；隨後接任的吳清基接任教育部長後，馬英九直接代替吳清基宣布要推動十二年國教政策，沒想到上台沒多久，吳清基就在許多爭議事件中下台，換蔣偉寧接手。

蔣偉寧更勇敢，許多準備工作都還未完成、就強推十二年國教上路，對學生、家長的宣傳與說明都不充分，導致全國家長與學生陷入痛苦中，讓學生不僅學習苦、考試苦、現在連分發都苦，種種亂象，除了荒腔走板，更讓人覺得這些官僚冷血。

教改失敗，不只是單純政策的問題，還有許多利益團體的因素介入，讓整個教育改革扭曲變形，折磨台灣的學生。無論如何，教改改到今日，是該做個總回顧與檢討，不能再盲目往下走了。